現在，PubMed Central(PMC)から論文を取得して解析しています．PMCに登録されている論文は全文利用できるのですが，登録されている論文の中にはXML形式でファイルを取得できない論文があります．（参考：放牧27日目：this article does not allow downloadin…

論文に書かれている塩基配列を抽出し，論文をゲノム配列にマッピングする事で，ゲノム配列の特定箇所について書かれた論文リストを作成する事を行っています． これには先行研究http://text2genome.smith.man.ac.uk/about.cgiがあります．今週はこのText2Gen…

9月末頃から活動内容が変わっているので，今後行っていきたい事をまとめました． 目標 論文中に現れる核酸塩基配列(ATGCUなどの文字列)をゲノム配列にマッピングし，「ゲノム配列のこの部分配列に関する論文リスト」を作成する事を目標としています．最終的…