2010-06-01から1ヶ月間の記事一覧

GEOのデータからGEOのIDとPubMedのIDを抽出

今までの「PubMedの論文データ → 実験データID」の逆で、「実験データ(データベース:GEO) → PubMedの論文データID」を抽出しました。IDはメタデータの以下の文字列に着目しました。 ・GEOのID !Series_geo_accession = xxxx xxxxがGEOのID ・PubMedのID !Se…

PubMedから外部データベースのIDを抽出

今回の変更点 (1) PubMedのXMLに書かれているPubMed Central (PMC)のIDには、今後追加される予定のIDも書かれています。これらを区別できるようにしました。 (2) 論文から抽出するIDを、外部データベースのID全てを抽出する様に変更しました。 (1) 今後PMCに…