2010-08-01から1ヶ月間の記事一覧

8月第2週の勤務

今週行った事 1.illlumina,http://www.454.com/publications-and-resources/all-publications.aspの文献リストから実験IDを抽出し,GEOのIDをSRAのIDに変換. 2.SRAのIDを抽出できたPubMedの論文から,meshが現れる頻度を求める. 1. GEO -> SRAの変換 実験…

8月第1週の勤務

目標:PubMedの論文と,書かれている次世代シーケンサーの実験ID(SRA)の対応を取りたい. 今週やったこと 1. 論文が出た時にはSRAのデータベースがなく,GEOのIDが書かれているものがあるかも.論文から抽出したGEOのIDを,SRAに変換してみる. 2. 論文検索…